Yunanistan'ın Batı Anadolu'yu işgali sırasında bu bölgede yaşayan Rumlar kendileri için yeni bir dönemin başladığı düşüncesine kapılmışlardır. Bu yüzden, kurdukları çeteler vasıtasıyla Türklerin yaşadığı köylere baskınlar düzenlemiş, soygunlar ve katliamlar yapmışlardır. Yunanistan ise işgal ettiği Batı Anadolu'yu kendi toprağı olarak kabul etmiş ve buralarda yaşayan Rumları silâhaltına çağırmıştır. Bu çağrıyı dikkate alan Rumlar, Yunan işgalinin sürdüğü yıllarda Yunan ordusuna her türlü desteği vermiş, Yunan ordusunun birçok tümeni Rumlardan oluşturulmuştur. Yunan ordularının Anadolu'da birçok şehri işgal ettiği haberlerini alan Rumlar bu durumdan son derece memnun olmuş ve eğlenceler düzenlemişlerdir. Ayrıca Rumlar, Yunan işgali kolaylaştırmak, işgalin kalıcı olmasını sağlamak amacıyla çeşitli teşkilat ve cemiyetler de kurmuşlardır.Fener Rum Patrikhanesi de, Rum çete teşkilatlarının oluşturulması, Osmanlı Devleti aleyhine gösteriler düzenlenmesi ve Yunanistan lehine yapılan propagandanın yaygınlaştırılması gibi faaliyetlerde aktif rol almıştır. Özellikle Fener Patrikhanesi'ne bağlı metropolitler Yunan amaçlarının gerçekleşmesi için din faktörünü kullanarak Rumları Türkler aleyhine kışkırtmışlardır.Yunanistan, topraklarını batılı devletlerin desteği ile daima Türkiye'nin aleyhine büyütmüştür. Bu büyüme sırasında ele geçirdiği topraklarda yaşayan Türklere müthiş bir mezalim uygulamıştır. Yunanistan bir hayal uğruna takip ettiği politikalar ile sadece Türkleri değil, aynı zamanda Rumları da mağdur etmiştir. Anadolu Rumları Kurtuluş Savaşı sırasında, Yunanistan'ın haris siyasetine alet olmuş, bunun sonucunda Anadolu'yu terk etmek mecburiyetinde kalmışlardır.